94年7月1日成立，第一任科主任林育民主任於98年2月1日上任。本科積極發展惡性骨腫瘤及軟組織腫瘤之肢體保存手術，與臺北榮總合作發展以液態氮冰凍療法後自體骨骼重建手術，作為體外高劑量放射線照射後自體骨骼重建手術之另一種選擇，目前已有初步成效。擇優選派主治醫師出國進修惡性骨腫瘤及軟組織腫瘤新的治療方式。推廣各類癌症轉移至長骨何時需作預防性內固定或關節置換手術之概念。第二任科主任陳昆輝主任於104年12月上任迄今，專長為脊椎相關手術，接任後專責於脊椎；薦尾椎及骨盆骨骨腫瘤及轉移性脊椎腫瘤之治療。
本科目前亦積極渣展骨腫瘤相關之顯微重建手術，林育民醫師並於105年1月赴巴塞隆納自至醫院進修相關手術技術。
本科陳昆輝主任積極發展脊椎及薦尾椎骨腫瘤全錐體切除術，配合本部李政鴻部主任長期發展且獨步全國之腰薦椎前位手術技術，可有效縮小前位手術之時間及傷口大小，另與泌尿外科機及合作發展腎細胞惡性腫瘤合併脊椎轉移時之泉錐體切除併重建手術，目前亦有初步成果，造福患者。