微生物科成立於民國71年，下設細菌組、血清組及病毒/分生組。人員編制由成立初期12 人，因作業量逐年增加為維持檢驗服務品質，經多次擴編至目前22人。民國110年9月因感染科實驗室業務屬性相同，院方指示感染科實驗室併入微生物科。

1. 自2008年12月起連續經美國臨床病理學會(The College of American Pathlogists CAP)認證委員實地訪視成為符合國際標準檢驗室，將臨床檢驗品質提升至國際水準，提供國人國際化最優質的醫療服務。
2. 自2010年 起連續通過財團法人全國認證基金會實驗室認證。
3. 1982年起細菌鑑定作業採手工6管生化鑑定，2014年細菌鑑定及藥物感受性試驗由VITEK 2細菌自動鑑定儀執行，2017年新增微生物質譜鑑定儀由分析微生物細胞的蛋白質組成將臨床微生物鑑定邁入新紀元。
4. 於2019年於後棟門診大樓5樓新建置分枝桿菌負壓實驗室，提供臨床分枝桿菌鑑定及藥物感受性試驗。
5. 血清病毒血清檢驗2010年建置自動酵素免疫分析儀(DS2)，2020年增加全自動冷光免疫分析儀(Liason XL)提高檢驗時效與品質。
6. 分生檢驗2021年引進Cobas 6800全自動核酸萃取儀；廠商提供儀器，試劑與 維修採三合一租賃方式，有效控制成本。

1. 本科每年接受中山醫學大學、中國醫藥大學、中台醫護技術學院、中華醫事學院、輔英技術學院、元培醫事科技大學、仁德醫護管理專科學校學生實習。
2. 配合醫檢師法之規定，同仁每年定期參加在職教育，以增進本職學能，提供完善檢驗諮詢。
3. 本科每年接受CAP、醫檢學會、疾病管制局等品管測試成績皆合格。
4. 配合臨床單位提報院內研究計劃，並陸續有論文發表。
 

1. 邁向微生物自動化的作業系統、擴展分子生物檢驗在臨床微生物檢驗的應用。
2. 儀器更新：採用性能佳速度快之自動儀器，以提高檢驗時效與品質。
3. 人員訓練：派員至相關單位進修或研習新技術。
4. 研究及發展：配合健保給付及臨床醫療需要，研發新檢驗項目，並鼓勵同仁積極參與臨床研究工作。

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