本中心分為四組，分別負責不同業務：

1. 病人衛教組：成立病友會，並讓患者分享彼此的治療心得，同時與各地區基層醫療單位合作，推廣攝護腺疾患及排尿障礙早期檢驗。 

2. 臨床試驗組：引進新藥，進行國內及國外相關攝護腺疾病治療試驗。 

3. 功能性復健組：協助病患進行排尿功能分析及復健治療。 

4. 研究發展組：負責基礎實驗，研發攝護腺疾病之分子生物化學特性及治療藥物。短期自行研究和醫學研究部合作，長期計劃能有一專任博士研究員。