中藥局

中藥局是一個精簡的單位，配合醫院的中醫部門，進行關於中藥藥事相關的臨床及藥品採購等行政作業；另配合醫院執行相關評鑑作業及中醫師、藥師訓練任務。

臨床試驗藥局

管理院內通過之所有臨床試驗案之藥品、主持人自行發起研究案之藥品。本部臨床試驗用藥管理於98年9月特奉核准增聘藥師一名專責管理臨床試驗用藥。並於急診藥局旁規劃設置臨床試驗藥局，與急診藥局搬遷改建工程同期動工，於98年12月完成建置作業並正式啟用。

開刀房藥局

本院104年派遣藥師至日本廣島大學病院標竿學習開刀房藥局運作模式，於106年9月正式成立，以衛星藥局形式設立於恢復室，近距離供應病人手術過程所需藥物，成立之初與麻醉科及資訊室合作，建立藥品供應作業流程，並開發藥品管理資訊系統，同時逐步擴展藥品供應業務涵蓋之手術室，107年2月第一醫療大樓麻醉科全面上線，白班管制藥及全日非管制藥皆由開刀房藥局發藥。